在进行工业洁净厂房的平面设计之前，应充分考虑各项工艺流程是否需会产生可燃性气体、可燃性粉尘、纤维，并计算其浓度高低等。从而确定洁净厂房内是否需要设置防爆区并计算防爆区的面积。
后，值得注意的是在现有规范中虽然要求有爆炸危险的设备宜避开厂房的梁、柱等主要承重部件布置，但由于设备尺寸、厂房面积、空调系统负载压力等多方面因素影响。在实际工程操作中实施难度较大，可在初次设计时适当提高防爆区主要承重结构的防爆性能。
需要注意不同工艺的特殊不同,如粉碎、过筛、压片、干燥等工艺，其具有产尘量大、噪声大的特点，出于对这一类别工艺的特性的考虑，为了方便除尘和管理，可以将产尘量大、有噪声的设备集中在一起。这些工艺若不能做到全封闭操作,则除了设计必要的捕尘、除尘装置外，为防止噪音和粉尘向外界传播还需要加设前室。
且根据当前生产条件和设备条件，生产不可能全部达到全封闭、全机械化、全管道化输送的水平。部分工艺仍然需要人工操作，如物料、中间体、内包材料的搬运、传递是仍靠人工操作完成的，所以在进行设计时不要陷入“人流、物流不交叉”的误解中去。但应坚持进入洁净区的操作人员和物料不能合用一个入口。