工程实行预付款的，合同双方应根据合同通用条款及价款结算办法的有关规定，在合同专用条款中约定并履行。
承包人应在签订合同或向发包人提供与预付款等额的预付款保函后向发包人提交预付款支付申请，发包人应在收到支付申请的7天内进行核实后向承包人发出预付款支付证书，并在签发支付证书后的7天内向承包人支付预付款。
它是施工准备和所需材料、结构件等流动资金的主要来源，国内习惯上又称为预付备料款。
工程预付款的扣回：
起扣点T=P-M/N， P为承包合同总合同额 M为工程预付款数额 N为主要材料和构件所占总价款的比重
预付备料款的额度，由合同双方商定，在合同中明确预付备料款计算的理论公式:
预付备料款=合同价款×预付备料款额度
备料款数额=全年施工工作量×主材所占比重÷年施工日历天×材料储备天数
备料款的数额，要根据工程类型、合同工期、承包方式和供应方式等不同条件而定
一般建筑工程不应超过工作量(包括水、电、暖)的30%；安装工程不应超过工作量的10%
性质
1、是独立于委托人与担保人之间的反担保或委托人与受益人之间的合同或投标条件之外的。
2、是依据其规定的条件生效的，由担保人以保函中规定的任何单据为基础做出决定的。
3、是不可撤销的。
维修保函
是指应承包方（申请人）的请求，向工程业主（受益人）保证，在工程质量不符合合同规定，承包方（申请人）又不能维修时，由银行按担保函规定金额赔付工程业主。该款项通常为合同价款的5%-10%。